Az Orvosi Mikrobiológiai Intézet kutatási tevékenysége számos területet ölel fel: humán papillomavírusok szerepe a genitális régió és a fejnyaki terület elváltozásaiban, genitális papillomavírusok transzkripciós és replikációs aktivitásának vizsgálata, DNS vírusok kóroki szerepe, humán patogén Candida fajok antifungális rezisztenciája, Gram-pozitív és Gram-negatív baktériumok antimikrobiális rezisztencia mechanizmusai.